Albert a eu une longue vie, loin d'être un fleuve tranquille.

Enlevé à ses parents alors qu'il n'est qu'un tout jeune bambin, il intègre un programme de recherches eugéniste nommé Projet W - dirigé par le Dr. Wesker et centré sur le virus Progenitor. Il a grandi dans l'un des orphelinats financés par Oswell E. Spencer, lui-même à l'origine du Projet W, et a reçu la meilleure éducation possible.

Fortement poussé par Spencer et les idéologies qu'il lui a secrètement transmises au fil des ans, Albert s'est tout naturellement tourné vers les biotechnologies. Recruté par Umbrella Pharmaceuticals à l'âge de 17 ans, il intègre leur propre centre de formation, l'Umbrella Executive Training School, où il est encore plus endoctriné avec son camarade de classe, William Birkin.

L'année d'après, lui et Birkin intègrent le laboratoire d'Arklay, où ils travaillent sur le virus T, dérivé du virus Progenitor.

En 1988 est ordonné l'assassinat d'un collaborateur de Spencer et co-créateur d'Umbrella Corporation, le Dr. James Marcus. Albert et Birkin récupèrent ainsi plus de dix ans de recherches sur le virus T qu'il gardait précieusement avec lui.

Un peu plus tard, Birkin est affecté à la recherche sur le virus Golgotha (G), et Albert décide de quitter lui aussi le laboratoire d'Arklay pour rejoindre le service de renseignements d'Umbrella Corp., soucieux de comprendre les motivations de Spencer derrière les recherches sur le virus G. Il y passe quelques années - passant également par l'armée américaine - avant de rejoindre, sur ordre d'Umbrella, les équipes du S.T.A.R.S., une unité des forces spéciales de Raccoon City. Il sera promu capitaine de l'équipe Alpha.

Note : au début des années 90, il a une aventure avec une jeune femme édonienne, qui tombera enceinte de lui. Cependant, les deux s'étant quittés avant qu'elle ne le sache, il ignore qu'il est le père d'un petit Jake.

En 1998, après un incident au manoir Arklay et une série de meurtres inexpliqués, l'affaire est confiée aux S.T.A.R.S. ; et Wesker reçoit l'ordre de guider ses équipes dans le manoir pour les livrer en pâture aux zombies qui y résident, afin de récolter diverses données de combat. Suite à un sabotage de leur hélicoptère, l'équipe Bravo disparaît dans la forêt de Raccoon City. L'équipe Alpha est lancée à leur recherche, atterrissant près du manoir Arklay dans lequel ils se réfugient après une attaque de Cerbères enragés. Wesker décide alors de trahir à la fois Umbrella et son équipe, et les manipule jusqu'à ce qu'ils arrivent dans le laboratoire Arklay, dans la salle du Tyran, qu'il réveille après s'être injecté une mutation du virus T : le virus Prototype.

Il meurt, empalé sur le bras du Tyran.

Mais le virus qu'il s'est inoculé le sauve, lui procurant (entre autres) des capacités régénératives hors du commun. Il s'enfuit avant l'autodestruction du manoir, et demeure caché quelques temps tout en rejoignant l'Organisation, une compagnie rivale d'Umbrella Corporation, malgré son échec pour récupérer les données promises.

Après avoir acquis le virus-G, l'Organisation envoie son groupe paramilitaire, H.C.F., à travers le monde à la recherche des diverses bases d'Umbrella, dans l'unique but de voler leurs données. En décembre 1998, Wesker est ainsi envoyé à Rockford Island à la recherche d'échantillons du virus T-Veronica, qu'il parvient à récupérer malgré sa rencontre fortuite avec Chris - un de ses anciens collègues - et Claire Redfield.

Durant plusieurs années, le rôle de Wesker au sein de l'Organisation évolue et celui-ci se retrouve à organiser la vente d'armes biologiques. En août 2002, il négocie la vente du virus T-Veronica au chef d'un cartel, Javier Hidalgo. Dans le même temps, il recrute Jack Krauser comme agent.

Début 2003, Wesker est envoyé dans une base secrète russe d'Umbrella pour récupérer l'U.M.F.-013, l'ordinateur contenant toutes les archives de la compagnie qui a été extrait du manoir Arklay par le colonel Vladimir, l'un des agents d'Umbrella, avant son explosion. Il y croise à nouveau Chris Redfield, cette fois-ci en compagnie de Jill Valentine, une autre de ses anciennes subordonnées. Il récupère une copie des données, efface les originales puis en envoie une copie au gouvernement américain, prouvant ainsi l'implication d'Umbrella dans l'épidémie de Raccoon City. Umbrella Pharmaceuticals fait faillite.

A l'aide des données récupérées dans la base russe, il se rapproche d'Excella Gionne une généticienne, et lui fournit suffisamment d'informations pour qu'elle parvienne à se hisser à la tête de la division africaine de Tricell, une organisation rivale d'Umbrella. Ils travaillent dès lors ensemble.

Au milieu de l'année 2004, il envoie Jack Krauser et Ada Wong en Espagne pour récupérer des échantillons de Las Plagas, un parasite. Malgré la trahison d'Ada et la mort de Krauser, Wesker parvient à récupérer ce qu'il était venu chercher. Il est ainsi en possession d'échantillons du virus T, du virus G, du virus T-Veronica et de Las Plagas.

Deux ans plus tard, Wesker retrouve la trace d'Oswell Spencer, qui lui avoue tout de ses origines : Albert a été "manufacturé", créé dans l'optique d'un projet encore plus grand que tout ce qu'il aurait pu imaginer. Il l'empale sur son bras, le tuant sur le coup, avant d'être interrompu par Chris Redfield et Jill Valentine - deux agents du BSAA. Ils se battent, et Jill finit par se défenestrer, entraînant Wesker avec elle dans sa chute.

C'est, dès lors, le début du projet Uroboros - un projet profondément eugéniste visant à infecter l'humanité toute entière avec un virus, tuant tous ceux possédant un patrimoine génétique inférieur et dotant tous les autres de capacités surhumaines, l'image de Wesker. Jill, kidnappée, devient un sujet d'expérience de choix parmi tant d'autres, puisque possédant les anticorps du virus T depuis l'incident de Raccoon City. Albert, de son côté, découvre qu'il a besoin de stabiliser le virus à l'intérieur de lui : c'est la création du PG67A/W, qu'il doit s'injecter régulièrement afin de conserver ses capacités surhumaines.

C'est en 2009 que Wesker planifie la libération d'Uroboros. Cependant, son plan échoue : Chris Redfield et sa nouvelle partenaire, Sheva Alomar, se dressent en travers de son chemin. Excella meurt, après avoir été infectée par le virus par Wesker - et sans faire partie des élus - et c'est ensuite le tour d'Albert, projeté dans la lave d'un volcan en activité et ensuite décapité à l'aide d'un lance-roquettes.

Son histoire aurait pu s'arrêter là.

Mais une lune rouge en a décidé autrement. Le premier janvier 2019, Wesker ouvre les yeux : il est de nouveau vivant. Projeté dans une ville inconnue, le virus en lui ayant disparu, il décide toutefois de reprendre ses projets de zéro tout en cherchant un moyen de récupérer ses pouvoirs. Il intègre ainsi une nouvelle compagnie pharmaceutique pour reprendre ses recherches en secret.