Agent du S.H.I.E.L.D, une agence de renseignement, d'intervention et de contre-terrorisme, Maria Hill a gravit les échelons avec les années jusqu’à devenir la directrice adjointe et donc la seconde de Nick Fury, avec lequel elle travaille. Sans aucun doute l’une des meilleurs agents de l’organisation, sa loyauté envers le S.H.I.E.L.D et surtout envers Fury n’est plus à prouver, bien qu'il lui arrive de ne pas toujours être d’accord avec lui. Maria aime beaucoup son travail et ce dernier occupe une place importante dans sa vie, elle ne prend que très rarement, voir jamais, de vacances. Alors qu’elle l’accompagne en visite sur le Projet P.E.G.A.S.U.S, un projet qu’ils ont en commun avec la NSA et où ils étudient le Tesseract, ce dernier est volé par Loki qui veut ouvrir un portail vers le monde des Chitauri, pour que ceux-ci envahissent New York. Il emmène également avec lui l’un de leur scientifique, mais également l’Agent Barton. Cela semble donc être le bon moment pour réunir les candidats qui étaient retenus pour le projet initiative Avengers qui n'a pourtant jamais vu le jour. Son but est de constituer une équipe de super héros, pour faire face à des menaces auxquelles le S.H.I.E.L.D n’est pas préparé. L’équipe est constituée de Natasha Romanoff/Black Widows, Bruce Banner/Hulk, Tony Stark/Iron Man et Steve Rogers/Captain America.

Maria avait moins d’espoir dans ce projet que son supérieur, mais elle fut présente à ses côtés pour le soutenir. Malgré la capture de Loki et la présence de Thor, venue leur prêter main forte, Loki parvient à s'échapper et à accomplir ses plans, tandis que le S.H.I.E.L.D perd un de ses membres, l’Agent Coulson. Alors que New York subi une invasion par les Chitauri auxquelles les Avengers tentent de mettre fin, le Conseil de sécurité mondial décide d’envoyer un missile sur la ville, mais Maria soutient la décision de Nick Fury et tente avec ce dernier d’empêcher l’envoie du missile, qui sera finalement envoyé par Iron Man dans le portail créé par le Tesseract. L'invasion repoussé, le conseil souhaite avoir son avis sur les Avengers et Maria donne donc son opinion: pour elle, les Avengers étaient une erreur, mais une erreur qui a fonctionné, car Nick Fury croyait en eux. Le conseil à beau dire que le directeur du S.H.I.E.L.D a fait des erreurs, Maria ne manque pas l'opportunité de leur rappeler que eux aussi. Les Avengers ont donc sauvé New York, mais Maria se demande si ces derniers vont revenir, lorsque le S.H.I.E.L.D aura de nouveau besoin d’eux.

Mise au courant de la résurrection de l’Agent Coulson par Nick Fury, ce dernier ayant utiliser le projet T.A.H.I.T.I, un projet secret de base destinée à ressusciter un Avenger si besoin, Maria l’aide à cacher la vérité sur la résurrection de Coulson, y compris au principal concerné. Elle aide son collègue à reprendre ses activités au sein de l’agence et à monter une équipe spéciale. Elle se charge alors de l’entrevue de Grant War et évalue sa loyauté envers le S.H.I.E.L.D avant de l'assigner à l’équipe de Coulson, dont elle supervise ensuite la première mission.

Alors que le S.H.I.E.L.D est sur le point de lancer le projet Insight, son supérieur est pris pour cible et Maria l'aide à fausser sa mort aux yeux du monde entier. Sa loyauté envers le S.H.I.E.L.D fut remise en question à cause de ses liens avec le Captain Roger, cherché par le S.H.I.E.L.D suite au décès de Nick Fury, mais aussi les Avengers. Écarté de la mission, cela n’arrête pas Maria qui se fait passer pour un agent d’Hydra, afin de libérer Steve Rogers, Natasha Romanoff et leur nouvel allié, un dénommé Sam Wilson, qui étaient capturés par ces derniers. Ayant alors compris qu’Hydra avait infiltré le S.H.I.E.L.D depuis des années, elle les a amené voir la directeur du S.H.I.E.L.D, révélant alors que Fury était bien en vie. Maria aida également à combattre Hydra et à détruire les Héliporteur du projet Insight au Triskelion, qui aurait fait un nombre incalculable de victimes. La mission fut réussie de justesse, mais les retombées ne furent pas très agréables.

C’est pourquoi pour se protéger des poursuites judiciaires, Maria passa un entretien d’embauche dans la compagnie de Tony Stark. Elle devient donc l’employé de ce dernier et de Pepper Potts, bénéficient alors de la protection des avocats de Stark Industries pour lui éviter d’aller en prison. Elle resta néanmoins en contact avec Fury, mais également avec Phil Coulson, dont Fury à confier la tâche de faire renaître le S.H.I.E.L.D. Maria fait donc le lien entre le S.H.I.E.L.D et les Avengers durant la guerre contre Hydra et continue à maintenir la sécurité mondiale. Néanmoins, elle fut interrogée par plusieurs agences telle que la NSA, CIA ou encore la NRO, sans oublier le Congrès des États-Unis. Durant cette période de sa vie, elle était placée sous surveillance de haut niveau par plusieurs agences, comme le FBI.

Au fil du temps, Coulson finit par apprendre la vérité sur son retour et l’Agent May lui a demandé de le surveiller. Elle lui demanda également qui était derrière le projet T.A.H.I.T.I., mais malheureusement Maria lui répondit simplement que Fury avait enterré l’information à ce sujet et qu’elle ne pouvait pas lui demander directement puisque Fury était mort avant la bataille de Triskelion, un mensonge auquel l’Agent May ne croit pas, mais leur conversation pris enfin fin après qu’elle fut retrouvé par des agents du FBI, auxquelles elle reprocha d’avoir mis beaucoup trop de temps à la localiser selon elle. Cherchant à éviter la prison à Coulson et son équipe, Maria choisit de donner la localisation de Fury à l’US Air Force.

Réuni avec Coulson, elle essaya de la convaincre, en vain, de laisser la base à Talbot et ses hommes et de leur donner quelques petites informations sur le S.H.I.E.L.D, mais fini par décidé de l’aider à combattre Talbot et son équipe, pour ensuite s’échapper et aller à la poursuite des Agent Ward et Garrett, qui étaient en réalité des agent d’Hydra. Après avoir retrouvé Grant Ward, elle lui demande de se rendre et s'occupe de le distraire, afin de laisser le temps à Coulson de monter à bord de l’avion et libérer Skye, l’une des Agent du S.H.I.E.L.D. Lorsque qu’il lui demande de lui fournir un soutien tactique pour attaquer l’Agent Garrett, Maria lui répondit simplement qu’il n’y avait plus de S.H.I.E.L.D. Elle proposa à Coulson de venir travailler chez Stark Industries, mais ce dernier refusa. C’est donc sans dire aurevoir et en le suppliant lui et son équipe d’arrêter leur association au S.H.I.E.L.D une fois Garrett arrêté que Maria les quitte.

Contacté par Coulson après qu’il ait réussi à localiser le Sceptre au main d’Hydra, elle reçut l’ordre de lancer le protocole Theta ainsi que d'envoyer les Avengers chercher le Sceptre et arrêter le Baron Strucker. Une mission que les Avengers ont réussi avec succès. Par la suite, elle discuta des jumeaux Maximoff et de leur pouvoir avec Captain America. Puis, elle assiste à la fête donnée par Tony Stark à la Tour des Avengers. Bien que la plupart des invités soit partie, la fête continue avant d’être interrompue par l’attaque d’une intelligence artificielle nommée Ultron. Bien entendu, elle fut la première à riposter. Après que Steve ai échoué à raisonner Ultron, Maria vient leur prêter main forte lors du combat contre l’armée d'Ultron. Bien que le corps d’Ultron fut détruit par Thor, l’un de ses mini robots parvient à s’enfuir avec le sceptre.

La chasse contre Ultron lancée, Maria découvre que ce dernier bénéficie de l’aide des jumeaux Maximoff et a fait des victimes. Malheureusement, les Avengers furent désignés comme coupables. C’est pourquoi Maria leur conseilla de se cacher un temps, d’autant plus que ces derniers étaient encore sous l’influence des pouvoirs de Wanda.

Lors de la bataille de Sokovie, elle recrute d’ancien agent du S.H.I.E.L.D afin de réunir une équipe de soutien pour aider les Avengers. Elle devient alors le commandant en second de Nick Fury et aide à évacuer les civils tandis que les Avengers sont en plein combat contre Ultron. Bien que ce ne fut pas facile, la bataille fut gagnée, Ultron détruit et des milliers de vies furent sauvées. Après cela, elle fut chargée d’aller aider au nouveau QG des Avengers, où elle travailla en collaboration avec Helen Cho, mais également avec Nick Fury avec lequel elle discuta des accords de Sokovie. Elle fut également témoin du fait que les Avengers étaient en train de s’effondrer.

Après la guerre civile des Avengers, Maria décide de quitter Stark Industries rejoint alors une petite équipe dirigée par Nick Fury pour lutter contre une invasion alien. L’équipe mena une recherche dans le monde entier, suite à la disparition de Tony Stark à bord d’un vaisseau spatial, sans jamais trouver. La conversation fut interrompue lorsque l’équipe repéra plusieurs objets non identifiés au-dessus de Wakanda. Avant qu’ils ne puissent entrer en contact avec Cameron Klein, Maria et Fury furent obligés de s’arrêter au beau milieu de la route à cause d’un accident de voiture. Allant vérifier le chauffeur de la voiture accidenté, elle n’y trouva personne.

Malheureusement, Maria fait partie des victimes de Thanos et disparaît donc en 2018. Elle revient cinq ans plus tard grâce aux Avengers restants, qui se sont battus pour ramener tous ceux qui avaient disparu. Malgré son manque de confiance envers Stark, elle fut attristée d’apprendre son sacrifice pour vaincre Thanos. Elle fut présente à ses funérailles par respect, avant de disparaître à nouveau, dans un autre monde cette fois. Le temps à passé depuis et Maria à eu tout le temps devant elle pour recréer le S.H.I.E.L.D, mais en mieux. Malgré la présence de la police, elle sait très bien qu’ils ne sont malheureusement pas armés et prêts pour affronter certaines menaces. Elle sait que ce monde risque d'avoir besoin d’une organisation compétente à ce niveau. Elle sait combien cette organisation s’est faite une mauvaise réputation au fil du temps dans son monde, avec Hydra mais également avec les sales petit secrets du S.H.I.E.L.D. Cependant, elle est bien déterminée à ne pas répéter les erreurs de ses prédécesseurs et d’enfin en faire quelque chose de bien.