C'est son histoire :
-Samuel Morgan est le grand frère de Nathan.
-Ils sont orphelin depuis que leur mère, suite à une grave maladie, se soit suicider. Leur père ne pouvant s’occuper de ses fils les abandonnera à l’orphelinat Saint Francis Boys’ home.
-Les liens se renforceront dans les épreuves entre les deux frères, Sam devenant une figure paternel pour son cadet sur qu’il il veillera constamment.
-Samuel sera en perpétuel conflit avec la direction de l’orphelinat qui le sermonnera, voir menacera de l’expulser, surtout à cause de ses fréquentes fugues.
-Il finira virer pour de bon.
-Il reviendra peu de temps après pour retrouver Nathan et le faire sortir de l’orphelinat pour lui montrer sa nouvelle moto et qu’il a trouver un boulot.
-Nathan voudrait que Samuel l’emmène avec lui, mais ce dernier explique qu’il ne peut pas pour l’instant.
-Pour remonter le moral à son cadet, il lui proposera d’aller retrouver les affaires de leur mère chez une vieille collectionneuse.
-Pendant le cambriolage, ils se feront surprendre par la propriétaire. Elle expliquera qu’elle était une archéologue et que leur mère l’aidait à découvrir d’anciens trésors.
-La vieille femme meurt d’une crise cardiaque et la police arrive sur les lieux et manque d’arrêter les deux frères.
-Sam et Nathan décidèrent de s’enfuir ensemble et d’adopter le nom de « Drake » comme leur mère leur disait qu’ils descendaient du célèbre corsaire anglais.
-Quelques années plus tard, Nathan fera se rencontrer Sam et Sully. L’homme prendra sous son aile les deux jeunes garçons, même si la relation entre lui et Sam fut souvent chaotique.
-Les deux frères alterneront entre leurs allés et sortis de prisons après leurs arnaques et pillages de sites archéologiques.
-Ils voulurent mener le plus gros coup, à savoir découvrir le trésor du pirate Henry Avery dont ils sont fan.
-Ils trouveront de l’aide auprès d’un riche héritier Rafe Adler pour pénétrer dans une prison panaméenne où se trouverait une piste menant au butin.
-Cela tourne mal quand un garde soudoyer par Rafe, fut tuer par ce dernier. Le trio s’enfuit mais dans la course poursuite, Sam tombe et fini prisonnier pendant longtemps.
-Bien plus tard, Adler le fera sortir en payant sa liberté. Il veut engager à nouveau Sam pour retrouver le trésor d’Avery car ses propres recherches ne mènent nulle part.
-Sam le doublera et ira retrouver Nathan qui le croyait mort depuis tout ce temps.
-Sam lui racontera qu’il est sortie de prison grâce à un puissant trafiquant de drogue nommer Alcazar pendant sa propre évasion. Mais en guise de « remboursement » Alcazar veut le trésor d’Avery sinon, passer un délai il tuera Sam.
-Les deux frères demanderont de l’aide à Victor Sullivan pour infiltrer une vente aux enchères où une croix de Saint Dismas est proposée et mènerait au trésor. Ils parviennent à la dérober et manquer de se faire tuer bien sûr.
-Les coordonnées trouvées mèneront elles à une église en écosse. Sauf que Rafe y menait des fouilles depuis des années sans jamais rien y retrouver. Les Drake seront mener à se mesurer à la milice privée de leur ancien partenaire.
-Après un passage à Madagascar, les Drake pensent découvrir l’île où se trouverait Libertalia, la société voulue parfaite des pirates et fondée par Henry Avery.
-Arriver là bas, ils retrouveront Adler, c’est la que Rafe montrera à Nathan que son frère lui a mentit et que c’est lui qui la libérer. Il laissera Nathan pour mort et emmènera Samuel pour qu’il finisse ce qu’il avait commencer.
-Il sera secouru par Nathan, Elena et Sully. Mais obsédé par le trésor, Samuel les abandonnera pour aller le retrouver dans une grotte.
-Sam arrivera au bateau d’Avery dans une crypte et dans lequel se trouve tout son trésor. Mais il sera neutraliser par Rafe.
-Nathan arriva à ce moment pour le sauver. Dans un combat à l’épée qu’il remporte sur Adler, Nathan secouera son frère et ils s’enfuiront de la grotte par la nage.
-Au moment des « adieux », Samuel acceptera de faire équipe avec Victor pour mener quelques coups encore, voulant poursuivre ses activités illégales de chasseurs de trésors.
-Il sera quelques temps plus tard contacter par contacter par Chloé Frazer. L’aventurière a besoin de son aide pour localiser la défense de Ganesh en Inde et mettre les bâtons dans les roues d’un chef de guerre extrémiste indien Asav.
-Il se fera engager (ou capturer) par se dernier, afin de devenir son spécialiste en histoire Hoysala mais le guidera constamment sur une fausse piste tout en aidant Chloé.
-Asav n’étant pas stupide, découvrira le double jeu de Sam.
-Réunit avec Chloé, Drake ne sera pas content de voir qu’elle a fait équipe avec Nadine Ross, une vielle « amie » du précèdent opus.
-Ils seront contraint de guider Asav dans la cité abandonnée Hoysala et se voir substituer la défense.
-Tous les trois se lanceront à la poursuite d’Asav et récupéreront la défense qui fut vendue à l’ancienne agence de mercenariat de Nadine.
-Chloé apprendra qu’Asav a échanger la défense contre une bombe qu’il veut envoyer par train en ville lors du marché.
-Sam ne sera pas de suite emballer d’aller jouer les héros, mais se ravisera et aidera Chloé et Nadine à monter dans le train.
-Une fois la ville sauvée, Samuel voudra convaincre les deux jeunes femmes de vendre au plus offrant la défense au lieu du musée, mais aura en guise de réponse, une part de pizza pour qu’il « profite de ce moment ».
-Son arrivé en ville est laisser libre au joueur ou à la joueuse aucune exigence donné si ce n'est être cohérent avec le personnage.
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